نوع ديگري از سلول‌هاي بنيادي بزرگسالان، سلولي است به نام سلول  بنيادي مزانشيمي كه آن را مي‌توان از بافت‌هاي مختلفي از جمله مغز استخوان به دست آورد. اين سلول‌ها قادرند به سلول‌هاي استخواني، غضروفي و چربي تبديل شوند. اين سلول‌ها همچنين ممكن است در ترميم ساير بافت‌ها نيز كمك كننده باشند. در حال حاضر مطالعات حيواني گسترده‌اي در حال انجام است كه تاثير اين سلول‌ها در درمان آرتروز و شكستگي‌هاي دير جوش و يا جوش نخورده مورد ارزيابي قرار دهند. اين سلول‌ها همچنين ممكن است قادر باشند كه سيستم ايمني افراد را نيز تنظيم نمايند.

چنان چه از اسم اين سلول‌ها برمي‌آيد، منشا آن‌ها جنيني است. جنين در اين تعريف عبارت است از يك جنين ۱۰ هفته‌اي. اغلب بافت‌هاي جنيني داراي سلول‌هاي بنيادي با قدرت تكثير و تمايزي بالا هستند. همانند بافت‌هاي بزرگسالي، سلول‌هاي به دست آمده از بافت‌هاي جنيني نيز ويژه بافت بوده و قادرند كه سلول‌هاي بالغ همان بافت را توليد نمايند.

درست هنگام تولد نوزاد، خون بند‌ناف حاوي تعداد متنابهي از سلول‌هاي بنيادي خون‌ساز است كه همانند سلول‌هاي خون‌ساز به دست آمده از مغز استخوان، در حال حاضر عمده‌ترين مصرف آن‌ها درمان بيماري‌هاي خوني و سرطاني است. همانند سلول‌هاي بنيادي بزرگسالان اين سلول‌ها هم تنها ويژگي خون‌سازي را دارند.

سلول‌هاي بنيادي روياني از جنين‌هاي تازه ايجاد شده، ( قبل از لانه گزيني در رحم) به دست آمده و از نظر تئوريك قادرند به همه انواع سلول‌هاي بدن يك موجود زنده تبديل شوند. با اين حال تبديل اين سلول‌ها به همه انواع سلول‌هاي بدن چندان هم قطعي نيست. علاوه بر آن قدرت تكثير بالاي اين سلول‌ها مي‌تواند موجب ايجاد سرطان بعد از پيوند در شخص شود. براي استفاده از اين سلول‌ها در درمان لازم است كه سلول‌هاي بنيادي روياني در محيط‌هاي آزمايشگاهي به طور مستقيم به سلول‌هاي بالغ مورد نياز تمايز يابند تا ضمن افزايش اثرات درماني، اثر سرطان‌زايي آن‌ها نيز كاهش يابد. هر چند كه اين سلول‌ها ابزار مناسبي براي درك بهتر بيماري‌ها و همچنين روند تكامل انسان است. ولي هنوز هيچ خدمت درماني با استفاده از اين سلول‌ها در انسان ارائه نمي‌شود.

چنان چه در تعريف سلول‌هاي بنيادي آمده است سلول‌‌‌‌هاي بنيادي داراي ۲ ويژگي تكثير و تمايز هستند و با توجه به توانايي آن‌ها در تمايز به انواع مختلفی طبقه‌بندی می‌شوند: سلول‌هاي همه توان، پرتوان، چند توان تك توان.

سلول‌هاي همه توان، سلول‌‌‌‌‌هاي بنيادي هستند كه قادرند علاوه بر توليد همه سلول‌هاي بدن، سلول هاي خارج جنيني مانند جفت را نيز توليد نمايند.

سلول‌هاي پرتوان عبارتند از سلول‌هايي كه قادرند همه انواع سلول‌هاي يك فرد بالغ را توليد نمايند ولي قادر به توليد سلول‌هاي خارج جنيني نيستند.

سلول‌هاي چند توان هم، مانند سلول‌هاي بنيادي بزرگسالان قادر هستند به يك رده خاصي از سلول‌ها، همانند سلول‌هاي خوني تمايز شوند.

بالاخره سلول‌هاي تك توان تنها قادر هستند به يك نوع خاص از سلول‌ها تمايز يابند.